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La formación de quistes está estrechamente relacionada con los procesos en la «zona de transformación» del cuello uterino. Durante la epidermización fisiológica (metaplasia) o postraumática (cicatrización de erosiones), el epitelio plano estratificado proliferante crece sobre el cilíndrico y obstruye los orificios de las glándulas funcionales (criptas). El secreto continúa produciéndose en la cavidad cerrada, sin salida al exterior. Esto conduce a la dilatación de la glándula y a la formación de un quiste de entre 2-3 mm a 1-2 cm, lleno de moco denso amarillento o transparente.
Los quistes de Naboth son un hallazgo frecuente en colposcopía (en el 10-20% de las mujeres en edad reproductiva) y se consideran una variante normal. Las múltiples quistes indican una cervicitis previa o un proceso activo de cicatrización de la ectopia. Los quistes grandes o múltiples pueden causar hipertrofia y deformación del cuello uterino, dificultar la visualización del canal cervical o servir como reservorio para infecciones crónicas, lo que es una indicación para la apertura (punción) y el drenaje.
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